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針對機場捷運目前累積虧損問題，桃園捷運公司提出說明表示：
1.至106年4月公司累積虧損17億餘元，主要係因公司自100年設立迄今，已經6年時間，因興建單位交通部高鐵局歷經6次跳票通車，直至106年3月2日正式營運通車，才開始售票營運，在此之前並無客運票箱收入來源，並非桃捷營運後虧損17億元。針對此營運前虧損17億餘元的費用，桃捷公司也多次行文並要求交通部高鐵局編列營運前虧損補貼，經多次爭取協調，提出12.87億元的營運前虧損補貼費用，目前仍積極向交通部爭取。
2.桃捷公司自105年起即積極向高鐵局爭取各項預算，以減少自有資金的累積虧損，並獲得5.5億元的備品預算，以及爭取106年高鐵局機場捷運工程結餘款7.12億元，作為系統改善及升級之經費，目前部分預算也獲得高鐵局同意。
3.桃捷公司自3月2日正式售票營運迄今，目前日平均運量達每日5.6萬人次，相較原預估4.6萬人次為佳，且運量持續穩定成長，對於一個營運不到3個月的營運公司，仍需社會大眾的支持，桃捷公司目前也針對三大客群(機場旅客、通勤旅客、輕旅行旅客)研議各項運量提升方案。
4.目前部分車站確實有運量偏低之情況，主要在A10,11,15,16,20車站，其主因為航空城都市計畫迄今未能通過，涉及多年來中央及地方政府的權責。其中，桃園市政府力促延宕多時的A10都市計畫，在鄭文燦市長的努力爭取下，已於106年初通過，市府交通局並規劃多班接駁公車，以期增加A10站運量，並疏導南崁地區的交通。
5.桃捷公司自未通車前，即積極協助各項測試工作，並提早進場進行各項設備設施的維護保養工作，終於完成國人期待順利通車目標，目前正式收費營運不到3個月，運量正穩定成長，也感謝絕大多數國人的肯定及支持。
在鄭文燦市長的督促期望下，6年內不提列重置基金的情況，桃捷公司也將提出6年平損計畫，透過開源節流及提升運量、增加附屬事業收入的面向，積極爭取機場公司入股桃捷，以期讓桃園機場捷運公司的財務能穩定平衡、達到永續發展的目標。
