行政院農業委員會（以下簡稱農委會）本著發展「優質農業」及「安全農業」的理念，提昇國產農水畜產品及其加工品的品質水準和附加價值，以保障生產者和消費大眾共同權益，與進口農產品作區隔，進而提昇國產農產品的競爭力，因此自1989年起著手推動CAS優良食品證明標章，建立國產農產品在國人心目中的良好形象，且能愛好使用國產品。2004年農委會為整合過去所推動之各類標章、標誌，公佈「優良農產品證明標章認證及驗證作業辦法」，統籌以CAS標章來推動優良農水畜產品及其加工品。
為持續加強推動CAS優良農產品驗證制度，2007年1月29日公佈農產品生產及驗證管理法，爰將CAS標章納入「農產品生產及驗證管理法」規範，並依據「優良農產品驗證管理辦法」及「農產品標章管理辦法」強化驗證管理及標章使用查核，確保消費者權益。
CAS優良農產品標章制度推行至今已27年，目前實施自願性優良農產品驗證制度之農林水產品及其加工品之項目計有肉品、冷凍食品、果蔬汁、食米、醃漬蔬果、即食餐食、冷藏調理食品、生鮮食用菇、釀造食品、點心食品、蛋品、生鮮截切蔬果、水產品、林產品、乳品及羽絨等16大項，凡申請驗證廠商及產品，由通過農委會認證之財團法人中央畜產會、食品工業發展研究所、工業技術研究院及台灣優良農產品發展協會等4個驗證機構聘請具有專業背景之學者、專家嚴格評核把關以及各項檢驗，通過後方授予CAS標章證明，由業者自行在通過驗證之產品標示CAS標章，保證CAS產品的品質及安全無虞。
CAS優良農產品有：1、CAS優良農產品之原料以國產品為主；2、衛生安全符合要求；3、品質規格符合標準；4、包裝標示符合規定等優勢，推行至今已普遍獲得國人的認同和信賴，並逐漸成為國產優良農產品的代名詞。
不料，近幾年來食品安全事件接連發生，發生問題之部分產品牽涉到政府推動之認證標章如CAS及GMP標章，因此消費者不知道如何才能買的安心、吃的放心，社會輿論嘩然，批評主導CAS及GMP認證之行政院農業委員會及經濟部工業局未善儘把關之責。
農委會於2011年新北市政府衛生局抽驗學童營養午餐食材驗出藥物殘留之際，即要求3個驗證機構加強生產廠（場）之稽核與產品抽驗外，更積極與教育部和衛福部組成聯合稽查小組，到全省各縣市盒餐工廠了解購買原料來源與使用情況並抽樣檢驗，在盒餐工廠赫然發現其使用之原料來源多元化，例如豬肉有購買CAS產品及非CAS產品，而且以非CAS肉品之數量較多，但地方衛生機關實施稽查時，並不確定所採樣品之來源，只憑廠商提供之CAS肉品證明書即做成採樣紀錄，當檢驗結果驗出藥物殘留時，即發布CAS肉品被驗出藥物殘留，嚴重傷害CAS標章之公信力。以下為CAS優良農產品標章制度執行的一些成果：
一、加強追蹤追溯管理：為防杜以非CAS產品混充為CAS產品，損害農民及消費者之權益，農委會於2011年起(食安法修正前)即要求各驗證機構於追蹤查驗時必須追查產品之原料來源及產品流向紀錄，並勾稽數量是否吻合，不符合者即取消CAS驗證資格。
二、加強產品區隔：為杜絕廠商以進口豬肉混充國產豬肉，農委會要求驗證機構於稽核時須嚴格稽查進出貨數量，如發現以進口豬肉混充國產豬肉時，即取消該產品之CAS驗證資格。為做好原物料之進銷存管理，3年多來有多家肉品工廠建立電子化追蹤追溯系統，便於原物料之管理並節省人力。
三、驗證基準配合食安法同步辦理：2014年2月5日食管法修正公布後，追蹤及追溯系統、HACCP、食品業者登錄、食品營養標示、過敏原標示、含基因改造食品原料標示、重組肉品名標示等各項辦法、準則、規定陸續發布，CAS驗證基準即機動配合辦理。CAS驗證制度，在國內各項驗證制度中為最嚴謹的，尤其執行面在農委會監督下，各驗證機構都戰戰兢兢，不敢有絲毫怠惰。
四、不預先通知追蹤查驗時間：為了解各驗證廠場平日作業是否符合驗證基準，因此不定期至各驗證廠場執行稽核工作。
五、全廠查核：針對原料肉、食品添加物及生產作業，過去僅針對CAS產品製造過程及使用於CAS產品之原料肉、添加物作追查，為因應食安問題不斷，農委會要求追蹤查驗時需作全廠稽查，避免非CAS產品使用來路不明之原料肉及不合法之食品添加物。
CAS驗證制度在執行面有其他驗證制度不及之處，但有些盲點仍待加強，茲舉例說明如下：
一、農產品原產地鑑別方法：CAS驗證制度屬產品驗證，通過驗證之產品，其品質及安全衛生都必須符合驗證基準，因此驗證機構必須落實品質規格、衛生標準、產地鑑別等各項檢驗工作。品質規格與衛生標準，國內驗證機構之實驗室均有能力檢驗，惟獨原產地之鑑識目前尚無實驗室有能力執行。2014年農委會開始執行冷藏肉與冷凍解凍肉之區隔檢驗，遏止廠商以進口冷凍肉解凍後混充國產冷藏肉販售，此舉獲得養雞產業熱烈之支持；但業者如以進口冷凍肉混充國產冷凍肉則無法以檢驗，因此政府應大力支持開發農產品產地鑑識方法，才能做好原料肉來源之把關。
二、追溯追蹤系統：CAS驗證制度之追溯系統目前只追到上一層來源，當產品發生問題時雖可往下游追蹤回收問題產品，但無法追溯到發生問題之牧場去作輔導與管理。最近媒體報導民進黨總統候選人蔡英文於2015台灣農業高峰論壇閉幕致詞時表示，為解決層出不窮的食安問題，檢驗是把關最後的手段，建立追溯系統才是解決之道，如她當選總統，將大力推動農產品產銷履歷制度。個人認為產品通過CAS驗證之廠商多已建立追溯與追蹤系統，如在CAS驗證制度上加強追溯系統，應可達事半功倍之效果。
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